Lämpökäsittely alentaa rehun mikrobimäärää erittäin tehokkaasti, sillä salmonella on lämpöherkkä bakteeri.

Suomen Rehun tehtaissa kaikki maatilarehut lämpökäsitellään. Lämpökäsittely tapahtuu useassa vaiheessa: esivalmennuksessa, varsinaisessa prosessoinnissa ja lopuksi rakeistuksessa. Höyryn ja paineen avulla lämpötila nostetaan prosessin aikana vähintään 80 Celsius-asteeseen. Useissa tuotteissa lämpötila nousee lyhytaikaisesti lähelle 100 astetta.

Lämpökäsittely alentaa rehun mikrobimäärää erittäin tehokkaasti. Lämpötilan pikainen nosto 80 asteeseen pudottaa mikrobimäärän jopa kymmenesosaan alkuperäisestä määrästä. Mikään teollinen rehunvalmistusprosessi ei tee rehusta täysin steriiliä.

Salmonella on lämpöherkkä bakteeri, joka kuolee noin 70 asteen lämmössä. Käytännössä muun muassa prosessointilämpötilalla, käsittelyajan pituudella on merkitystä: korkeaa lämpöä käytettäessä riittää lyhyt käsittelyaika ja alempaa lämpötilaa käytettäessä käsittelyajan tulee olla pidempi.

Maatilarehut ovat täysrehuja, puolitiivisteitä ja tiivisteitä yksimahaisille tuotantoeläimille sekä märehtijöille.